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云南省天麻与真菌共生生物学重点实验室项目竞价公告
| 项目名称 | 云南省天麻与真菌共生生物学重点实验室项目 | 项目编号 | **** |
| 项目编号 | **** | ||
| 公告发布日期 | **** 08:29 | 公告截止日期 | **** 08:29 |
| 公告截止日期 | **** 08:29 | ||
| 采购单位 | 点击登录查看 | 付款条款 | 合同签订后一次性支付全款 |
| 联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系手机 | 中标后在我参与的项目中查看 |
| 联系手机 | 中标后在我参与的项目中查看 | ||
| 是否本地化服务 | 否 | 是否需要踏勘 | 否 |
| 是否需要踏勘 | 否 | ||
| 踏勘联系人 | 踏勘联系电话 | ||
| 踏勘联系电话 | |||
| 踏勘地点 | 踏勘联系时间 | ||
| 踏勘联系时间 | |||
| 采购预算 | ￥356,700.00 | ||
| 送货/施工/服务期限 | 合同生效之日起30日内 | ||
| 送货/施工/服务地址 | 点击登录查看（知行楼实验室） | ||
采购清单
1
| 采购内容 | 计量单位 | 采购数量 | 售后服务 | |||
| 转录组测序 | 个 | 300 | 免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 | |||
| 参考品牌及型号 | 不限定品牌型号 | |||||
| 技术参数要求 | 1.要求：具有二代及以上测序平台；提供样品RNA提取服务；每个样本测序数据量不少于6 Gb ，数据Q30质控不低于90%；对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理；提供可进行个性化分析的在线云报告系统和在线云工具； 2.分析内容：提供基因分析（包括新基因鉴定、基因类型统计、基因覆盖度统计、测序饱和度分析、基因测序随机性分析），基因表达量统计（包括表达量计算，表达量丰度分布），样本关系分析（包括PCA、相关性系数热图），差异表达基因分析（包括差异表达基因统计、火山图、热图、GO分析、KEGG分析），PPI分析（包括String数据库蛋白互作网络分析、网络图绘制），GSEA分析，RNA编辑，InDel/SNP突变分析，基因可变剪切鉴定，已知基因结构优化。 3.服务内容：包括样本处理+建库+测序+结题报告+在线报告系统+标准分析。 4. 在线分析平台行业影响力高（平台用户数和文章引用数作为关键评估指标），需要包含以下转录组数据分析需要的功能： （1）修改样本名称分组名称；（2）筛选样本重新分析；（3）差异分析，功能富集分析；（4）转录因子分析；（5）可变剪切分析；（6）目标基因的分析；（7）目标基因分子总览，全面展示目标基因结果；（8）常见数据库查询目标基因信息，string，BioGrid，ChIPBase，ENCORI,TRRUST-Target_gene,TRRUST-Transcription_factor；（9）具有图表交互功能，便于筛选查询和作图。 5.售后服务：免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 6.学术资格：近3年协助在《Cell》、《Nature》或《Science》主刊中发表过SCI论文，且协助发表多篇15分以上TOP期刊论文。 7.项目经验：连续3年有大样本检测分析经验。 | |||||
采购清单
2
| 采购内容 | 计量单位 | 采购数量 | 售后服务 | |||
| 非靶向代谢组 | 个 | 250 | 免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 | |||
| 参考品牌及型号 | 不限定品牌型号 | |||||
| 技术参数要求 | 1.要求：检测平台使用Q-Exactive系列质谱仪（Thermo），并完成相应的信息分析。提供可进行个性化分析的在线云报告系统和在线云工具； 2.分析内容：开展代谢物定性定量分析、聚类分析、多元统计分析、差异代谢物鉴定及分析、代谢通路分析、趋势分析等。 3.服务内容：包括样本处理+建库+测序+结题报告+在线报告系统+标准分析。 4.在线分析平台行业影响力高（平台用户数和文章引用数作为关键评估指标），需要包含以下代谢组数据分析需要的功能： （1）修改样本名称分组名称；（2）筛选样本重新分析；（3）多元统计分析，功能富集分析；（4）大样本代谢组数据机器学习模型分析，支持向量机分析、随机森林分析、弹性网络分析、逻辑回归分析、朴素贝叶斯分析；（5）目标代谢物分子总览，全面展示目标分子结果；（6）具有图表交互功能，便于筛选查询和作图。 5.售后服务：免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 6.学术资格：近3年协助在《Cell》、《Nature》或《Science》主刊中发表过SCI论文，且协助发表多篇15分以上TOP期刊论文。 7.项目经验：连续3年有大样本检测分析经验。 | |||||
采购清单
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| 采购内容 | 计量单位 | 采购数量 | 售后服务 | |||
| 蛋白质组学测序（DIA） | 个 | 150 | 免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 | |||
| 参考品牌及型号 | 不限定品牌型号 | |||||
| 技术参数要求 | 1.要求：运用direct DIA技术，对样本进行液质联用检测，通过生物信息分析鉴定蛋白并进行定量分析。提供可进行个性化分析的在线云报告系统和在线云工具； 2.分析内容：质谱准确度评估，考蛋白数据库建立（DIA），白数据库建立与Mascot软件搜索（LFQ），蛋白质鉴定与定量，蛋白质功能注释（GO功能、KEGG代谢通路、COG/KOG），白高级注释（蛋白结构域分析、转录因子分析、亚细胞定位分析），异蛋白分析（差异基因筛选、差异比较火山图、差异比较热图），差异蛋白功能富集分析，GSEA分析。 3.服务内容：包括蛋白提取+液相色谱分离+物质检测+数据分析+结题报告+在线报告系统+标准分析。 4. 在线分析平台行业影响力高（平台用户数和文章引用数作为关键评估指标），需要包含以下蛋白质组数据分析需要的功能： （1）修改样本名称分组名称；（2）筛选样本重新分析；（3）差异分析，功能富集分析；（4）转录因子分析；（5）具有图表交互功能，便于筛选查询和作图；（6）线粒体功能富集分析数据库； 5.售后服务：免费交互式云平台；数据分析解答；报告解读；免费云端培训视频课程；生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 6.学术资格：近3年协助在《Cell》、《Nature》或《Science》主刊中发表过SCI论文，且协助发表多篇15分以上TOP期刊论文。 7.项目经验：连续3年有大样本检测分析经验。 | |||||
采购清单
4
| 采购内容 | 计量单位 | 采购数量 | 售后服务 | |||
| 全基因组甲基化测序 | 个 | 50 | 数据分析解答，报告解读，免费云端培训视频课程，生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 | |||
| 参考品牌及型号 | 不限定品牌型号 | |||||
| 技术参数要求 | 1.要求：对DNA样品完成全基因组甲基化测序，测序深度为30x，并进行相应的信息分析； 2.分析内容：对测序数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估；去接头污染、去低质量reads和产量情况统计， 酶转化处理效率检测， 测序序列与参考基因组序列的比对，深度和覆盖度分析，C 碱基的甲基化水平， 全基因组甲基化水平分布趋势，基因组DNA甲基化图谱，差异甲基化分析。 3.服务内容：包括基因组随机打断+转化+DNA甲基化文库构建+文库质量检测+上机测序+数据分析+结题报告+标准分析。 4、售后服务：数据分析解答，报告解读，免费云端培训视频课程，生物培训班服务；具有独立的生信分析团队，可派遣项目负责成员到合作方参与项目数据分析；安排硕士以上学历且具有多组学测序与数据分析3年及以上工作经验的专业分析和技术团队跟进整个项目周期，提供前期实验和质控的指导，符合质量的测序数据，完善的流程分析结果，对采购方提出的生物学问题，能以生物信息学的逻辑给出建议，共同讨论数据分析方案，针对文章审稿过程中生物信息学部分给出相应的答复。 5.学术资格：近3年协助在《Cell》、《Nature》或《Science》主刊中发表过SCI论文，且协助发表多篇15分以上TOP期刊论文。 6.项目经验：连续3年有大样本检测分析经验。 | |||||
